郵送で難病の医療費助成の申請をしてもいいですか。

はい。郵送で申請いただく場合も、申請先は住所地を所轄する保健所（保健センター）になります。なお、消印の日付が申請日となります。
書類の不足や事故等の防止のため、あらかじめ、住所地を所轄する保健所（保健センター）にご相談ください。