固定資産税ではテナントが施工した内装部分などは償却資産として課税されています。なぜ不動産取得税では不動産（家屋）として課税されるのですか。

固定資産税では一定の条件に該当するものについては、不動産（家屋）を償却資産とみなし、償却資産として課税されますが、不動産取得税ではそのような制度はありません。

したがって、原則どおり不動産（家屋）として、課税されることになります。